Für Zuweisende

Molekulargenetisches Leistungsverzeichnis des IfGH

Im Rahmen der Multi-Gen-Panel-Sequenzierung (MGPS) handelt es sich dabei in aller Regel um einen EuroGen Typ A‐Test, d.h. eine umfassende Analyse nach derzeitigem Stand der Wissenschaft und Technik.

Aktuelle Empfehlungen zur Indikation einer erkrankungs-spezifischen Genotypisierung:

• Gendiagnostik bei kardiovaskulären Erkrankungen. Konsensuspapier der Deutschen Gesellschaft für Kardiologie (DGK), der Gesellschaft für Humangenetik (GfH) und der Deutschen Gesellschaft für Pädiatrische Kardiologie (DGPK). Kardiologie 2023, 17:300–349
• European Heart Rhythm Association (EHRA)/Heart Rhythm Society (HRS)/Asia Pacific Heart Rhythm Society (APHRS)/Latin American Heart Rhythm Society (LAHRS) Expert Consensus Statement on the state of genetic testing for cardiac diseases. Europace. 2022 Sep 1;24(8):1307–1367
• 2022 ESC Guidelines for the management of patients with ventricular arrhythmias and the prevention of sudden cardiac death. Eur Heart J. 2022 Oct 21;43(40):3997–4126
• 2023 ESC Guidelines for the management of cardiomyopathies. Eur Heart J. 2023 Oct 1;44(37):3503–3626

Kardiovaskuläres Genpanel (360 Gene; sog. „Technische Genliste“ bzw. Untersuchungsgene) der Multi-Gen-Panel-Sequenzierung (MGPS) (Custom Panel V2):

ABCC9, ABCG5, ABCG8, ACAD9, ACTA1, ACTA2, ACTC1, ACTN2, ADCY8, AGL, AKAP9, AKT3, ALG10B, ALMS1, ALPK3, ANK2, ANKRD1, APOA4, APOA5, APOB, APOC2, APOE, ATP2A2, ATP6V1A, ATP6V1E1, BAG3, BGN, BMP10, BMP2, BMP4, BRAF, CACNA1C, CACNA1D, CACNA1G, CACNA1H, CACNA1I, CACNA1S, CACNA2D1, CACNB2, CALM1, CALM2, CALM3, CALR3, CAMK2A, CASQ2, CAV3, CBL, CBS, CCND2, CDH2, CDKL5, CETP, CHD4, CHRM1, CHRM2, CHRM3, CLCA2, CNTAP2, COL1A1, COL3A1, COL4A3, COL5A1, COL5A2, COX15, CREB3L3, CRELD1, CRYAB, CSRP3, CTF1, CTNNA3, CYP2C19, DCBLD2, DCHS1, DES, DLG1, DLL1, DMD, DNAJB6, DNAJC19, DOLK, DPP6, DSC2, DSG2, DSP, DTNA, DZIP1, EFEMP2, ELN, EMD, EPHB4, EYA4, FBN1, FBN2, FHL1, FHL2, FHOD3, FKBP1A, FKRP, FKTN, FLNA, FLNC, FOXE3, FXN, GAA, GATA4, GATA6, GATAD1, GCKR, GJA1, GJA5, GJC1, GJD3, GLA, GNB1, GNB2, GNB3, GNB4, GNB5, GNG11, GPD1L, GPIHBP1, GREM2, GRIN2A, GSTM3, GYG1, HADHA, HCN1, HCN2, HCN4, HFE, HRAS, HSPB8, ILK, ISL1, JAG1, JPH2, JUP, KCNA5, KCNAB2, KCNB2, KCND2, KCND3, KCNE1, KCNE2, KCNE3, KCNG2, KCNH2, KCNJ11, KCNJ12, KCNJ16, KCNJ2, KCNJ3, KCNJ4, KCNJ5, KCNJ8, KCNK1, KCNK17, KCNK2, KCNK3, KCNK4, KCNMA1, KCNN1, KCNN2, KCNN3, KCNN4, KCNQ1, KCNT1, KLF10, KLF13, KLF5, KLHL24, KRAS, KRT19, LAMA2, LAMA4, LAMP2, LDB3, LDLR, LDLRAP1, LEMD2, LMF1, LMNA, LOX, LPL, LTBP2, LTBP3, LZTR1, MAP2K1, MAP2K2, MAT2A, MECP2, MEF2A, MFAP5, MIB1, miR-139-3p, miR-1976, miR-370-3p, miR-423-5p, MLYCD, MRAS, MRPL44, mt-TI, MURC, MYBPC3, MYH11, MYH6, MYH7, MYL2, MYL3, MYL4, MYLK, MYLK2, MYO6, MYOM1, MYOT, MYOZ2, MYPN, NEBL, NEXN, NF1, NGFR, NKX2-5, NNT, NODAL, NONO, NOTCH1, NOTCH3, NPPA, NRAP, NRAS, NUP155, OBSCN, ORAI1, PCSK9, PDLIM3, PDYN, PIK3CA, PIK3R2, PITX2C, PKD1, PKD2, PKP2, PLEC, PLEKHM2, PLN, PLOD1, POPDC1, POPDC2, PPA2, PPP1CB, PPP1R13L, PRDM16, PRKAG2, PRKAR1A, PRKG1, PRKRA, PSEN1, PSEN2, PTPN11, RAF1, RANGRF, RASA1, RASA2, RBM10, RBM20, RBM24, RCAN3, REST, RGS4, RGS6, RIT1, RNF207, RPL3L, RRAD, RRAS, RYR1, RYR2, SALL4, SASH1, SCN10A, SCN1A, SCN1B, SCN2A, SCN2B, SCN3B, SCN4A, SCN4B, SCN5A, SCN8A, SCN9A, SCNN1A, SCO2, SDHA, SEMA3A, SEPN1, SGCB, SGCD, SGCG, SGO1, SHOC2, SHOX2, SKI, SLC22A5, SLC25A3, SLC25A4, SLC2A10, SLC4A3, SLC8A1, SLM2, SLMAP, SMAD2, SMAD3, SMAD4, SMAD9, SMARCB1, SNTA1, SOS1, SOS2, SPEG, SPRED1, SREBF2, STAMBP, STIM1, TANGO2, TAZ, TBX18, TBX20, TBX3, TBX5, TCAP, TECRL, TGFB2, TGFB3, TGFBR1, TGFBR2, TJP1, TMEM168, TMEM43, TMEM70, TMPO, TNNC1, TNNI3, TNNI3K, TNNT2, TPM1, TRDN, TRIM63, TRPC1, TRPC3, TRPM4, TRPM7, TSFM, TTN, TTR, TXNRD2, , VAPB, VARS2, VCL, VEZF1, VSNL1, XRCC4, ZFY, ZHX3, ZIC3.

Genreferenzen: Liste der Genreferenzen (NM-Nummern)

Erkrankungs-spezifische Genlisten („Bioinformatische Genlisten“, bioinformatisch analysierte Gene) des kardiovaskulären Genpanels

Für die Erkrankungen gibt es jeweils bioinformatische Genlisten, die auf Anfrage zur Verfügung gestellt werden können.

Limitationen der NGS-Analyse: ‚Sequencing gaps‘ (partielle, reduzierte Sequenzabdeckung eines Targets), mangelnde Uniformity of coverage (inhomogene Sequenzabdeckung). Keine Detektion von mitochondrialen DNA-Varianten, reduzierte Sensitivität bei organ-spezifischen Mosaiken, größere Deletionen/Insertionen (>20 bp), Repeat-Expansionen (methodisch nicht analysierbar), Homopolymeren, Varianten in Pseudogen-Sequenzen. Zudem umfassen die NGS-Targetbereiche nicht regulatorische, tief-intronische Genbereiche (>10 bp im Intron). Genkonversionen, komplexe Inversionen, balancierte Translokationen werden ebenfalls nicht detektiert. Keine Analyse von Imprinting oder Trinukleotid-Expansionen.

Genetische Zusatzbefunde nach Untersuchung und Analyse des kardiovaskulären Genpanels

Im Rahmen der umfassenden, molekulargenetischen Analysen der MGPS ist es denkbar, dass in einem nicht-indikationsbezogenen Gen der "Technischen Genliste" ebenfalls ein Befund (bzw. eine relevante Genveränderung) für eine Zweiterkrankung gefunden wird (sog. „secondary finding“, Zusatzbefund), d.h. eine genetische Prädisposition für eine weitere, nicht-bekannte oder bislang nicht-erkannte Zweiterkrankung. Die mögliche Relevanz eines solchen Befundes hängt dabei sowohl vom Genbefund als auch der möglichen, assoziierten Erkrankung (sog. „actionable genes" ab, d.h. von einer klinischen Relevanz und etwaigen Behandlungsmöglichkeit. Miller DT et al. (2023) ACMG Secondary Findings Working Group. ACMG SF v3.2 list for reporting of secondary findings in clinical exome and genome sequencing: A policy statement of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Genet Med., PMID: 37347242

Voraussetzung für eine mögliche Berücksichtigung von Varianten in nicht-indikationsspezifischen Genen der "Technischen Genliste" ist eine vorherige, vollumfängliche Aufklärung und Einwilligung der Patient*innen. Ein Anspruch auf die erweiterte, umfassende bioinformatische Analyse oder gar eine vollständige Auswertung der "Technischen Genliste" und die Erhebung und Mitteilung von solchen Zusatzbefunden im Rahmen der MGPS besteht jedoch nicht.

Für folgende, kardiovaskulären Gene (> 60) sind Untersuchungsverfahren mittels Sanger-Sequenzierung nach DIN EN ISO 15189akkreditiert und als Leistung verfügbar:

ACTA2, ACTC1, ACTN2, ANK2, CACNA1C, CACNA1D, CACNA2D1, CACNA1S, CACNB2, CALM1, CALM2, CALM3, CASQ2, CAV3, CYP2C19, DCHS1, DES, DSC2, DSG2, DSP, DTNA, FLNA, FLNC, GATA4, GLA, GNB2, GPD1L, HCN4, KCNA5, KCNE1, KCNE2, KCNE3, KCNE5, KCNH2, KCNJ2, KCNJ3, KCNJ5, KCNJ8, KCNJ11, KCNK17, KCNQ1, LAMP2, LMNA, MYBPC3, MYH6, MYH7, NKX2-5, PKP2, PLN, PRKAG2, PTPN11, RBM20, RRAD, RYR2, SCN1B, SCN2B, SCN3B, SCN4B, SCN5A, SLC4A3, TAZ, TECRL, TGFBR1, TGFBR2, TMEM43, TNNI3, TNNI3K, TNNT2, TPM1, TRDN, TRPM4.

Zusätzlich zum Spektrum der zuvor gelisteten Untersuchungsgene sind weitere Gene aus wissenschaftlichen Projekten („Forschungsgene“) für DNA-Untersuchungen etabliert.

• Akkreditierungsurkunde
• Anlage zur Akkreditierungsurkunde
• Liste der akkreditierten Untersuchungsverfahren
• Declaration in accordance with Art. 5 no. 5 of Regulation (EU) 2017/746 on in vitro diagnostic medical devices and repealing Directive 98/79/EC and Commission Decision 2010/227/EU (IVDR)