AG Wethmar – Translationale Regulation der Genexpression
Upstream open reading frames (uORFs) sind regulatorische Sequenzelemente der 5´-untranslatierten mRNA-Region und kommen in fast allen humanen Transkripten vor. Viele uORFs steuern die Translation des nachgelagert kodierten Hauptproteins in Abhängigkeit unterschiedlicher extra- und intrazellulärer Signale. Außerdem kodieren einige uORFs selbst für Proteine (uPeptide), die wichtige zelluläre Funktionen steuern.
Mechanismen der uORF-vermittelten translationalen Expressionskontrolle
Die folgende Abbildung illustriert verschiedene Mechanismen der uORF-vermittelten Regulation anhand mehrerer mRNA-Modelle mit 5´-cap-Struktur (schwarze Punkte), 5´-untranslatierter Region (schwarze Striche), vorgelagerten uORFs (orange) sowie der kodierenden Sequenz des Hauptproteins (CDS, blau). GCN4 = amino acid starvation-responsive transcription factor GCN4.
(Abb. nach Wethmar 2014, WIRES RNA)
Unsere Forschung
Unsere Arbeitsgruppe untersucht die funktionelle Bedeutung uORF-assoziierter Mutationen und die Rolle der uPeptide bei der Krebsentstehung. Ziel unserer Forschung ist es, uORFs und uPeptide für gezielte (immun-)therapeutische Interventionen nutzbar zu machen.
Kontakt/Teamleitung
Priv.-Doz. Dr. med. Dr. rer. nat. Klaus Wethmar
Facharzt für Innere Medizin, Hämatologie und Onkologie
Oberarzt der Medizinischen Klinik A, Abteilung für Hämatologie, Hämostaseologie, Onkologie und Pneumologie
Kontakt
Unser Team
Dr. med. Lina Kolloch
Assistenzärztin
- The Emerging Role of uORF-Encoded uPeptides and HLA uLigands in Cellular and Tumor Biology. (Jürgens L, Wethmar K.)
- The new uORFdb: integrating literature, sequence, and variation data in a central hub for uORF research. (Manske F, Ogoniak L, Jürgens L, Grundmann N, Makałowski W, Wethmar K.)
- Upstream open reading frames regulate translation of cancer-associated transcripts and encode HLA-presented immunogenic tumor antigens. (Nelde A, Flötotto L, Jürgens L, Szymik L, Hubert E, Bauer J, Schliemann C, Kessler T, Lenz G, Rammensee HG, Walz JS, Wethmar K)
- Somatic Functional Deletions of Upstream Open Reading Frame-Associated Initiation and Termination Codons in Human Cancer. (Jürgens L, Manske F, Hubert E, Kischka T, Flötotto L, Klaas O, Shabardina V, Schliemann C, Makalowski W, Wethmar K)
- Loss-of-function uORF mutations in human malignancies. (Schulz J, Mah N, Neuenschwander M, Kischka T, Ratei R, Schlag PM, Castaños-Vélez E, Fichtner I, Tunn PU, Denkert C, Klaas O, Berdel WE, von Kries JP, Makalowski W, Andrade-Navarro MA, Leutz A, Wethmar K)
- Comprehensive translational control of tyrosine kinase expression by upstream open reading frames. (Wethmar K, Schulz J, Muro EM, Talyan S, Andrade-Navarro MA, Leutz A)
- The regulatory potential of upstream open reading frames in eukaryotic gene expression. (Wethmar K)
Medizinische Klinik A (Hämatologie, Hämostaseologie, Onkologie und Pneumologie)
Albert-Schweitzer-Campus 1
Gebäude A1
48149 Münster